Amaç

ADGRG1 geni, hücre-matriks iletişimi, immün hücre biyolojisi ve tümör bağlamına özgü sinyal düzenlenmesiyle ilişkili bir adezyon G proteinine bağlı reseptör olan GPR56’yı kodlar. Bu çalışmada ADGRG1/GPR56’nin insan kanserlerindeki genomik, transkripsiyonel, prognostik, immün ve farmakogenomik profili değerlendirildi.Gereç ve Yöntem: Bu in silico pan-kanser çalışmada, klinik ve cBioPortal temelli analizler için 32 analitik kohorttan 10.953 TCGA PanCancer Atlas hastası değerlendirildi; GEPIA2 analizlerinde COAD ve READ ayrı tutularak 33 kanser tipi incelendi. ADGRG1/GPR56 ekspresyonu GEPIA2 ile; genel sağkalım Kaplan–Meier, log-rank ve Cox regresyon analizleriyle; genomik alterasyonlar cBioPortal ile; immün infiltrasyon TIMER3 ile; ilaç duyarlılığı ise GDSC ve CTRP veri setleri kullanılarak GSCA üzerinden değerlendirildi.Bulgular: ADGRG1/GPR56 ekspresyonu 33 kanser tipinin 16’sında tümör ve normal dokular arasında anlamlı farklılık gösterdi. Nominal Kaplan–Meier analizinde genel sağkalımla anlamlı ilişki baş-boyun skuamöz hücreli karsinomu, berrak hücreli renal hücreli karsinom, mezotelyoma, kutanöz melanom ve üveal melanomda saptandı. Bu beş kohort içinde ilişki, BH-FDR düzeltmesi uygulanan sürekli Cox analizinde kutanöz melanom dışındaki tüm kohortlarda anlamlılığını korudu. Genomik alterasyonlar nadirdi ve olguların yaklaşık %1’inde görüldü; tekrarlayan mutasyon sıcak noktası saptanmadı. İmmün analizlerde CD4+ T hücresi, CD8+ T hücresi ve makrofaj ilişkili imzalarla tümör tipine özgü ilişkiler görüldü. Farmakogenomik analizlerde CTRP’de sitotoksik ve mitotik ajanlarla, GDSC’de seçilmiş epigenetik ve PI3K/mTOR ilişkili ajanlarla çoğunlukla direnç-benzeri; EGFR/ERBB ve MEK/MAPK inhibitörleriyle ise duyarlılık-benzeri korelasyonlar saptandı.Sonuç: ADGRG1/GPR56 insan kanserlerinde bağlama bağlı bir profil göstermekte olup klinik önemi tekrarlayan genomik alterasyonlardan çok tümöre özgü ekspresyon, immün mikroçevre durumu ve farmakogenomik örüntülerle ilişkili görünmektedir.